建文初，朱橚又以谋反之名被贬为庶人，后复召还京。永乐元年正月，汴梁发生河患，朱橚向成祖进言，不要使民力劳顿，成祖于是罢止。永乐十八年十月，有人状告朱橚造反，次年二月被召回京，朱橚叩首请求死罪，成祖怜惜，不再过问。
洪熙元年，卒于开封。
朱橚好学，能词赋，曾作《元宫词》百章，又组织编著《保生余录》、《袖珍方》和《普济方》等医学作品， 其中以《救荒本草》成就最为突出。
明朝初年，由于长期战乱，中原地区赤地千里，加上水旱灾害频发，黄河多次决口，导致饿殍遍野，普通百姓，只能以草根树皮果腹。为了帮助穷苦百姓度过饥荒难关，并用身边植物治疗疾病，从洪武二十四年（1391年）开始，朱橚在开封府邸开辟了一个植物园，种植开封本地的可食用植物，以及河南嵩山地区、豫晋交界太行山区、豫北地区的可食用植物。在这些植物中，除米谷、豆类、瓜果、蔬菜等供日常食用的之外，还记载了一些必须经过加工处理才能食用的有毒植物，以便荒年时借以充饥。
同时，朱橚组织了一个学者团队，对这些植物进行观察、研究、绘图，描述其形态、生长环境，以及加工处理烹调方法。朱橚还派学者认真总结劳动人民在长期食用野生植物过程中积累的经验知识，认真总结历代中医本草学著作对野生植物的认识和利用。