迭奉谕旨：“不论汉回，只论良莠。”仁育义正之怀，昭然若揭。回民亦具人心，岂独毫不知感？无如仇衅四结，每苦无处求生，莫知祸之所届。臣维解散安抚，实办回不可少之着。因于经历屯垦之余，划出荒绝地亩稍成片段者，以处求抚之陕回。现在平凉大岔沟等处，收抚陕回老弱妇女及务农丁壮约数千人，均给以赈粮、牲畜、籽种，课其耕作，与赈抚各属灾黎，招辑屯垦，一律办理，以广皇仁。
回民军扫荡陕西一事，给左宗棠招来了来自全国高官的一浪批评。当对金积堡的围攻进展到1870年秋季时，北京开始认为左宗棠一事无成。10月上旬，他接到一份上谕：
陕甘回匪滋事以来，朝廷轸念西陲，大伸挞伐，特命左宗棠为钦差大臣，督兵剿贼，厚集兵力，宽予限期，计每岁拨用饷银不下八百余万两，该大臣于行军、筹饷事宜有所陈奏，无不立见施行，倚畀不谓不重。乃自抵甘以后，虽据迭报胜仗，总未能痛扫贼氛，致金积堡一隅之地，至今日久未下，逆首稽诛，军务安有了期！竭东南数省脂膏，以供西征军实。似此年复一年，费此巨帑，岂能日久支持？该大臣扪心自问，其何以对朝廷？