不过，他也为学术刊物，本校《杭师院（大）学报》、《杭州大学学报》、《现代城市》（浙大城市学院学报），以及专业杂志《历史研究》、《中国地方志》、《中国烹饪》等撰稿。与此同时，还有介绍南宋及杭州历史文化的小品与通俗短文发表在地方上或行业刊物上，诸如，《杭州》、《杭州政协》、《杭州建设》、《杭州消防》、《杭州旅游》、《杭州美食》、《杭州佛教》、《杭州统战》、《杭州月志》、《天目山》等。
一般来说，在杂志上发表的稿子，大多是他的最新创作。因为一部专著的完成，并非能一蹴而成，需要经年累月的努力才能面世。由此，在各个报刊上发表的许多内容，实际上是他的最新研究创作成果，让读者先睹为快。当然，也有部分文章在已出版的书籍上有了，但是书本只能在小众范围内流通，报刊能用最快的时速、最直接的方式传递给大众。
《杭州》杂志，从二00七年开始，林正秋就在《杭州》杂志撰文。