忽必烈非常生气，说：“你不要多说了。朕拔汝布衣，授之政柄，遇汝不薄，何负而为此?"乃命左右斥去，绑缚起来。
随后，忽必烈把窦默、姚枢、王鹗、刘秉忠、张柔等人召来，拿出王文统给李壇的三封书信，向他们问道：“汝等谓文统当得何罪?”文臣皆言：“人臣无将，将而必诛。”张柔则大声喊道：“宜剐!”忽必烈又说：“汝同辞言之。”窦默等人异口同声说道：“当死。”于是，忽必烈就把王文统处死了。
忽必烈对王文统私通李壇之事既有清醒的认识，处理又特别谨慎。他听了回回的话，回答说：“昔姚公茂(姚枢)尝言王文统必反，窦汉卿(窦默)亦屡发其奸，秀才岂尽反耶。”忽必烈虽然这么说，但对曾经推荐过王文统的廉希宪、张易、商挺、赵良弼、刘秉忠等汉族文人仍然有所怀疑。
兴元同知蜀地降人费正寅乘机上告廉希宪是王文统在西南地区的朋党，商挺为王文统的羽翼，又引陕西行省都事赵良弼为辅等。
于是，忽必烈下令将商挺、赵良弼逮捕审讯。经审讯和调查，发觉费正寅完全是以私怨主观臆度和诬告，立即宣布商挺和赵良弼无罪，予以释放。被怀疑的其他幕府旧臣也在查明事实真相后解除了嫌疑，并继续受到重用。